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細菌保存是對活體微生物群體進行有效保存，使菌體不死、不衰、不變，便于研究和應用。菌種保存方法有很多種。保存原理是利用干燥、低溫、隔離空氣的方法，降低微生物菌株的新陳代謝速度，使菌株的生命活動處于休眠狀態，從而達到保存的目的。
液氮超低溫保存法的原理是冷凍細胞，停止其代謝活動，使細胞長期處于休眠狀態。一般來說，儲存溫度越低，效果越好。在液氮中，溫度可達到-196℃，因此從適用的微生物范圍、生存期和狀態穩定性來看，液氮超低溫保存法是一種理想的保存方法。
在-196℃下保存菌種，其存活率受冷凍速度的影響尤為明顯。一般來說，防凍劑應添加到菌種懸浮液中。冷凍保護劑是二甲亞砜和甘油，冷凍效果慢。
該方法一般保存菌種20年以上。除了適合一般微生物的保存外，還可以長期保存一些微生物，如支原體、衣原體、氫細菌、霉菌、噬菌體和動物細胞，難以形成孢子，性狀不變異。對于那些只在培養基上產生菌絲體的真菌，特別是擔子菌中的菌株，必須用這種方法保存，才能取得令人滿意的效果。該方法的操作技術并不復雜，只要有液氮罐或液氮冰箱設備。
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